ebi版とkogiidena版は混ぜたらだめ?

土日にぼちぼちいじっていたんだけど、どうも混ぜるとダメみたい。
DHCPクライアントがうまくアドレス取れなくなったり、モジュール関係の動作がダメになったりしている。スタティックアドレスでの運用はできるし、procもちゃんと動いているのにlsmodがダメなんてどういうことだろう。それ以上は見てないのだけど。
kogiidena版からebi版にすると、baseのパッケージのほとんどが入れ替わる。なので、ひょっとするとebi版にある問題なのか、それとも同じソースとはいえビルド環境の違うkernel,glibcの問題なのかも。
結局自分でやらなきゃダメってことなのかな...